El sector servicios es el dominante en la ciudad. El comercio se nutre de clientes de la provincia y de Portugal. Debido a importancia de las relaciones comerciales con Portugal, en 2006 se inauguró una nueva instalación de la Institución Ferial de Badajoz (IFEBA), junto a la frontera del río Caya.

También representa un importante nudo de comunicaciones con el país vecino, en donde está previsto la construcción de una Plataforma Logística y la llegada del tren de Alta Velocidad para 2015. La ciudad cuenta, asimismo, con un aeropuerto, situado a 14 km de la ciudad, un Palacio de Congresos y un parque de ocio y de atracciones (Lusiberia).

La ciudad cuenta con un gran polígono industrial llamado "El Nevero" el cual se encuentra continuamente en proceso de expansión. En él se encuentran instaladas empresas de los sectores más variados.

En verano de 2007, se presentó el proyecto de construcción de la nueva sede de la Caja de Badajoz, que comenzó a edificarse en octubre de 2008. Esta entidad construirá un centro financiero que contará con un edificio de 88 metros de altura, lo que lo convertirá en el edificio más alto de Extremadura. La construcción de este centro representa la buena salud que empieza a gozar la economía de la ciudad.

El área de influencia comercial de Badajoz se sitúa en el primer puesto regional con 570.457 habitantes, situándose en el 25º puesto de España, según el Anuario Económico de España 2007, que edita el Servicio de Estudios de La Caixa.